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上海起發(fā)biodynamics DS410說(shuō)明書

更新時(shí)間:2022-02-17      點(diǎn)擊次數(shù):2225


上海起發(fā)biodynamics DS410說(shuō)明書


biodynamics提供*的生命科學(xué)研究試劑。


DynaCompetent® 細(xì)胞 IS 突變安全

(舊產(chǎn)品名稱:LowInSeq)


基因組中 DNA 型轉(zhuǎn)座因子 (IS) 活性降低的大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞。您可以確保準(zhǔn)備好質(zhì)粒??捎糜诳寺?duì)大腸桿菌造成負(fù)擔(dān)的大型構(gòu)建體。

*本產(chǎn)品由 Biopalette Co., Ltd. 的專技術(shù) Target-AID® 開發(fā)。



 



實(shí)際上,當(dāng)將質(zhì)粒引入和擴(kuò)增到大腸桿菌中時(shí),就會(huì)出現(xiàn)這樣的問(wèn)題。

LowInSeq,圖 1

LowInSeq,圖 2


DynaCompetent® Cells IS-mutation Safe

本產(chǎn)品以DH5α為原株,在大腸桿菌基因組中ISs之間的IS2、IS5、IS10、ISEc63(相似序列)的轉(zhuǎn)座酶翻譯區(qū)使用Target-AID®終止密碼子。 大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞* 1

* 1雖然 IS 的活性降低,但不保證 IS 不會(huì)轉(zhuǎn)移。

 



減少 IS 插入質(zhì)粒


確認(rèn) IS 插入

質(zhì)粒的頻率降低 用耐氨芐青霉s質(zhì)粒 (30 kb, pUC Ori) 轉(zhuǎn)化本產(chǎn)品和大腸桿菌 DH5α 菌株后,進(jìn)行 24 小時(shí)液體培養(yǎng),最多進(jìn)行 6 次繼代培養(yǎng)。在上述每次培養(yǎng)過(guò)程中純化質(zhì)粒,

并使用HiSeq進(jìn)行下一代測(cè)序以估計(jì)插入IS * 2 * 3, 4的質(zhì)粒的大致比例。

該產(chǎn)品抑制了 IS 插入 DH5α 菌株的質(zhì)粒。

* 2 IS:IS1、IS2、IS3、IS4、IS5、IS10、IS30、ISEc5、IS609、ISEc63的總數(shù)。

* 3 DH5α菌株在+6次傳代培養(yǎng)時(shí)計(jì)算為超過(guò)100%,這表明兩個(gè)或多個(gè)IS插入到一個(gè)質(zhì)粒中。

* 4單獨(dú)將相同質(zhì)粒插入DH5α菌株,傳代6次后分離出9個(gè)克隆,進(jìn)行Sanger測(cè)序,證實(shí)了高IS插入率。

 




上述質(zhì)粒用BamHI消化并進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。該質(zhì)粒中有2個(gè)BamHI位點(diǎn),原本產(chǎn)生2個(gè)條帶,但通過(guò)重復(fù)傳代次數(shù)確認(rèn)了在DH5α株中條帶模式發(fā)生了變化。建議將 IS 插入質(zhì)粒。另一方面,用該產(chǎn)物傳代的質(zhì)粒抑制了條帶模式的變化。


防止 IS 對(duì)質(zhì)粒功能區(qū)造成損害的示例


DH5α

GFP 熒光在 48.6% 的菌落中消失或減弱

IS-突變安全

GFP 熒光沒(méi)有消失或衰減(沒(méi)有 IS 插入)*5

將該產(chǎn)物和大腸桿菌DH5α菌株用具有在lac啟動(dòng)子控制下的GFP的質(zhì)粒(不同于上述“減少的IS插入質(zhì)粒"圖和遷移圖的質(zhì)粒)轉(zhuǎn)化。將得到的菌落液體培養(yǎng)18小時(shí),再傳代6次。繼代培養(yǎng)后,將培養(yǎng)液涂布在LB平板上培養(yǎng)過(guò)夜。在獲得的菌落中觀察到GFP的熒光。

結(jié)果,在DH5α中出現(xiàn)的48.6%的菌落中,GFP的熒光消失或減弱,但在該產(chǎn)物中,沒(méi)有確認(rèn)其中GFP的熒光消失或減弱的菌落。當(dāng)從DH5α菌株中GFP熒光消失或減弱的菌落中提取質(zhì)粒并測(cè)序時(shí),所有克隆均在lac啟動(dòng)子,或DNA型轉(zhuǎn)座因子IS2或在lac啟動(dòng)子與GFP基因之間插入IS10L。

另一方面,在該產(chǎn)品和來(lái)自熒光DH5α菌落的質(zhì)粒中,從lac啟動(dòng)子到GFP的區(qū)域被完整地保留。

通過(guò)繼代培養(yǎng),DH5α產(chǎn)生了質(zhì)粒因插入IS而受損的克隆,但證實(shí)該產(chǎn)物抑制了IS對(duì)質(zhì)粒的損傷。

* 5使用本產(chǎn)品,即使是完整的質(zhì)粒,在 LB 板上觀察到的 GFP 的熒光強(qiáng)度也低于 DH5α 的熒光強(qiáng)度(它具有可見熒光)。在該產(chǎn)品中,在 lac 啟動(dòng)子控制下的 GFP 的表達(dá)水平可能低于 DH5α。然而,質(zhì)粒被克隆和純化沒(méi)有任何問(wèn)題。

規(guī)格


  • 轉(zhuǎn)化效率:> 1 x 10 8 CFU / μg (pUC19)

  • 附有 10 × 1 ml SOC 培養(yǎng)基

  • 不適用于卡塔赫納法規(guī)

產(chǎn)品

代碼

產(chǎn)品名稱容量價(jià)格

* 1

DS410DynaCompetent® 細(xì)胞 IS 突變安全10x100 微升39,000 日元

 

 

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